Immune cell | Biomarker | TIMER | GEPIA | ||
---|---|---|---|---|---|
R value | p value | R value | p value | ||
B cell | CD19 | 0.20*** | 7.11E − 06 | 0.24*** | 4.2E − 08 |
CD79A | 0.11* | 1.46E − 02 | 0.16*** | 2.3E − 04 | |
T cell | CD3D | 0.38*** | 1.01E − 18 | 0.34*** | 1E − 15 |
CD3E | 0.39*** | 2.59E − 20 | 0.41*** | 6.4E − 22 | |
CD2 | 0.44*** | 1.93E − 26 | 0.47*** | 2.6E − 30 | |
CD8 + T cell | CD8A | 0.19*** | 9.38E − 06 | 0.22*** | 2.9E − 07 |
CD8B | 0.18*** | 2.95E − 05 | 0.21*** | 1.9E − 06 | |
CD4 + T cell | CD4 | 0.41*** | 6.8E − 12 | 0.41*** | 6.8E − 22 |
Monocyte | CD86 | 0.33*** | 8.38E − 15 | 0.36*** | 3.1E − 17 |
CSF1R | 0.21*** | 1.55E − 06 | 0.23*** | 1.2E − 07 | |
TAM (general) | CCL2 | 0.35*** | 6.00E − 16 | 0.35*** | 4.5E − 16 |
CD68 | 0.42*** | 3.5E − 25 | 0.43*** | 3.5E − 25 | |
IL10 | 0.34*** | 4.17E − 15 | 0.37*** | 1.1E − 18 | |
M1 | IRF5 | 0.30*** | 5.12E − 12 | 0.31*** | 3.7E − 13 |
PTGS2 | 0.04* | 3.87E − 02 | 0.091** | 3.9E − 02 | |
NOS2 | − 0.13** | 2.3E − 03 | − 0.11** | 1.4E − 02 | |
M2 | CD163 | 0.45*** | 4.3E − 24 | 0.42*** | 4.3E − 24 |
VSIG4 | 0.30*** | 8.18E − 12 | 0.31*** | 2.5E − 13 | |
MS4A4A | 0.44*** | 2.8E − 29 | 0.47*** | 2.8E − 29 | |
Neutrophils | CEACAM8 | − 0.01 | 8.2E − 01 | 0.0019 | 9.7E − 01 |
ITGAM | 0.28*** | 8.97E − 11 | 0.29*** | 8.6E − 12 | |
CCR7 | 0.33*** | 3.68E − 14 | 0.34*** | 6.8E − 16 | |
Natural killer cell | KIR2DL1 | 0.12** | 5.1E − 03 | 0.16*** | 2.7E − 04 |
KIR2DL3 | 0.22*** | 3.79E − 07 | 0.25*** | 1.2E − 08 | |
KIR2DL4 | 0.23*** | 8.55E − 08 | 0.28*** | 1.8E − 10 | |
KIR3DL1 | 0.11* | 1.3E − 02 | 0.16*** | 3E − 04 | |
KIR3DL2 | 0.10* | 1.9E − 02 | 0.17*** | 1.3E − 04 | |
KIR3DL3 | 0.01 | 9.7E − 01 | 0.019 | 6.6E − 01 | |
KIR2DS4 | 0.18*** | 3.52E − 05 | 0.19*** | 1.1E − 05 | |
Dendritic cell | HLA-DPB1 | 0.49*** | 1.6E − 33 | 0.5*** | 1.6E − 33 |
HLA-DQB1 | 0.42*** | 6.5E − 15 | 0.33*** | 6.5E − 15 | |
HLA-DRA | 0.52*** | 4.6E − 38 | 0.53*** | 4.6E − 38 | |
HLA-DPA1 | 0.52*** | 7.7E − 38 | 0.52*** | 7.7E − 38 | |
CD1C | 0.36*** | 8.18E − 17 | 0.34*** | 8.2E − 16 | |
NRP1 | 0.49*** | 3.43E − 33 | 0.5*** | 1.5E − 34 | |
ITGAX | 0.23*** | 1.51E − 07 | 0.23*** | 1.2E − 07 | |
Microglia | CX3CR1 | 0.216*** | 7.78E − 07 | 0.23*** | 1.6E − 07 |
P2RY12 | 0.075 | 8,75E − 02 | 0.1 | 0.02 | |
ITGAX | 0.229*** | 1.51E − 07 | 0.23*** | 1.2E − 07 | |
FCGR1A | 0.29*** | 2.34E − 11 | 0.26*** | 3.9E − 09 | |
TMEM119 | 0.205*** | 2.6E − 06 | 0.23*** | 6.3E − 08 | |
CD33 | 0.331*** | 1.25E − 14 | 0.32*** | 1E − 13 | |
Monocyte-derived Macrophages | MRC1 | − 0.099 | 2.4E − 02 | − 0.061 | 0.16 |
CD163 | 0.45*** | P < 0.001 | 0.42*** | 4.3E − 24 | |
CD14 | 0.362*** | 1.23E − 17 | 0.38*** | 7.2E − 19 | |
TEK | − 0.033 | 4.49E − 01 | 0.0087 | 0.84 | |
THBD | 0.249*** | 1.14E − 08 | 0.29*** | 3.7E − 11 | |
ICAM1 | 0.429*** | 1.69E − 24 | 0.44*** | 2.2E − 26 | |
ITGA4 | 0.47*** | P < 0.001 | 0.49*** | 1.4E − 32 |