A microarray-based pathogen chip for simultaneous molecular detection of transfusion–transmitted infectious agents

De Giorgi, Valeria; Zhou, Huizhi; Alter, Harvey J.; Allison, Robert D.

doi:10.1186/s12967-019-1905-4

Table 2 Test results based on log ratio

From: A microarray-based pathogen chip for simultaneous molecular detection of transfusion–transmitted infectious agents

	CK	DEN1	DEN2	DEN3	DEN4	HAV	HCV1a	HCV2a	HCV3	HEV	HIV-1	HIV-2	HTLVI	HTLVII	WNV	ZKV	NC
CK	2.42	− 1.15	− 1.22	− 0.04	− 0.28	− 0.50	− 0.24	− 0.35	− 0.56	− 0.02	− 0.99	− 0.68	− 0.42	− 0.96	− 0.97	− 0.20	− 0.96
DEN1	− 0.12	1.60	− 0.33	0.09	0.14	− 0.08	− 0.20	− 0.31	− 0.52	0.46	− 0.76	− 0.55	− 0.28	− 0.76	− 0.53	0.00	− 0.86
DEN2	− 0.24	− 0.82	1.84	− 0.30	− 0.25	− 0.24	− 0.17	− 0.28	− 0.49	− 0.11	− 1.13	− 0.89	− 0.52	− 0.84	− 1.00	− 0.28	− 1.01
DEN3	0.03	− 0.19	− 0.02	1.62	− 0.24	− 0.28	− 0.24	− 0.34	− 0.55	0.01	− 0.95	− 0.81	− 0.56	− 0.91	− 0.22	0.05	− 0.96
DEN4	0.07	− 0.31	− 0.64	0.18	1.80	− 0.64	− 0.17	− 0.28	− 0.49	− 0.20	− 1.02	− 0.80	− 0.66	− 1.05	− 0.30	− 0.36	− 1.07
HAV	− 0.06	− 0.97	− 1.24	− 0.25	− 0.34	2.97	− 0.21	− 0.31	− 0.52	0.35	− 0.78	− 0.47	− 0.35	− 0.71	− 1.22	− 0.04	− 0.69
HCV1	0.46	− 0.53	− 0.55	0.63	0.56	0.26	2.91	2.80	2.59	0.79	− 0.30	0.94	0.44	− 0.05	− 0.43	0.60	− 0.37
HCV2	0.47	− 0.60	− 0.72	0.66	0.31	0.09	2.16	2.85	1.84	0.76	− 0.53	0.65	− 0.10	− 0.37	− 0.05	0.50	− 0.32
HCV3	0.39	− 0.73	− 0.77	0.06	0.06	− 0.07	2.63	2.53	2.32	0.34	− 0.28	0.92	0.02	− 0.51	− 0.68	0.28	− 0.46
HEV	0.41	− 0.62	− 0.63	0.23	0.35	1.06	− 0.14	− 0.24	− 0.45	1.89	− 0.31	− 0.17	0.10	− 0.04	− 0.51	0.54	− 0.39
HIV1	0.96	0.55	0.08	0.77	0.56	0.01	0.05	− 0.06	− 0.27	1.07	1.89	0.46	− 0.22	0.06	0.13	0.92	0.23
HIV2	− 0.13	− 0.90	− 0.94	0.02	− 0.29	− 0.07	− 0.09	− 0.20	− 0.41	0.23	0.91	1.68	− 0.07	− 0.44	− 0.75	0.09	− 0.66
HTLVI	− 0.57	− 1.29	− 1.43	− 0.35	− 0.55	− 0.51	− 0.06	− 0.17	− 0.38	− 0.21	− 1.08	− 0.87	2.67	0.88	− 1.47	− 0.15	− 0.99
HTLVII	− 0.21	− 1.11	− 1.19	− 0.45	− 0.40	− 0.21	0.19	0.08	− 0.13	− 0.09	− 0.92	− 0.59	0.38	3.30	− 1.13	− 0.10	− 0.86
WNV	0.10	− 0.50	− 0.70	0.21	− 0.34	− 0.33	− 0.19	− 0.29	− 0.51	0.25	− 0.62	− 0.52	− 0.40	− 0.64	2.24	0.00	− 0.82
ZKV	− 0.29	− 0.64	− 0.92	− 0.49	− 0.41	− 0.45	0.12	0.26	0.32	0.68	− 0.96	− 0.68	− 0.52	− 0.78	0.16	2.07	− 0.83

Positive results are reported in italics
CK, Chikungunya virus; DEN, dengue; HAV, hapatitis A virus; HCV, hepatitis C virus; HEV, hepatitis E virus; HIV, human immunodeficiency virus; HTLV, human T-cell lymphotropic virus; WNV, West Nile Virus; ZKV, Zika Virus; NC, negative control

Back to article page

ISSN: 1479-5876

Contact us

Submission enquiries: Access here and click Contact Us
General enquiries: info@biomedcentral.com

Journal of Translational Medicine

Contact us