Table 1 Colocalization results of eQTLs for 11 genes with RA-associated SNPs
Gene | PP.H0 | PP.H1 | PP.H2 | PP.H3 | PP.H4 |
|---|---|---|---|---|---|
CCR6 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
HLA-DPA1 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
HLA-DRB1 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
IFNGR2 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
C5 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 |
ATP2A1 | 0.000 | 0.014 | 0.000 | 0.000 | 0.986 |
FEN1 | 0.002 | 0.000 | 0.013 | 0.000 | 0.984 |
OPRL1 | 0.000 | 0.215 | 0.000 | 0.000 | 0.785 |
FCGR2B | 0.000 | 0.620 | 0.000 | 0.338 | 0.042 |
ITPR3 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 1.000 | 0.000 |