Table 2 The conformational B-cell epitope prediction for the final PspA1-5c+p construct using EliPro server
No | Residues | Number of residues | Score |
|---|---|---|---|
1 | A:K115, A:L116, A:K117, A:E118, A:I119, A:D120, A:E121, A:S122, A:E123, A:S124, A:E125, A:D126, A:Y127, A:A128, A:K129, A:E130, A:G131, A:F132, A:R133, A:A134, A:P135, A:L136, A:Q137, A:S138, A:K139, A:L140, A:D141, A:A142, A:K143, A:K144, A:A145, A:K146, A:L147, A:S148, A:K149, A:L150, A:E151, A:E152, A:L153, A:S154, A:D155, A:K156, A:I157, A:D158, A:E159, A:L160, A:D161, A:A162, A:E163, A:I164, A:A165, A:K166, A:L167, A:E168, A:D169, A:Q170, A:L171, A:K172 | 58 | 0.816 |
2 | A:M1, A:G2, A:H3, A:H4, A:H5, A:H6, A:H7, A:H8, A:L9, A:E10, A:K11, A:A12, A:L13, A:K14, A:E15, A:I16, A:D17, A:E18, A:S19, A:D20, A:S21, A:E22, A:D23, A:Y24, A:V25, A:K26, A:A59, A:E60, A:I61, A:A62, A:K63, A:L64, A:E65, A:K66, A:D67, A:V68, A:E69, A:D70, A:F71, A:K72, A:N73, A:S74, A:D75, A:G76, A:E77, A:Q78, A:A79, A:G80, A:Q81, A:Y82, A:L83, A:A84, A:A85, A:A86, A:E87, A:E88, A:D89, A:L90, A:V91, A:A92, A:K93, A:A95, A:E96, A:K99 | 64 | 0.78 |
3 | A:D489, A:A490, A:E491, A:L492, A:E493, A:L494, A:E495, A:K496, A:V497, A:L498, A:A499, A:T500, A:L501, A:D502, A:P503, A:E504, A:G505, A:K506, A:T507, A:Q508, A:D509, A:E510, A:L511, A:D512, A:K513, A:E514, A:A515, A:A516, A:D518, A:A519, A:N520, A:I521, A:E522, A:A523, A:N526, A:K527, A:D530, A:N533, A:K534, A:V535, A:A536, A:E537, A:L538, A:D539, A:K540, A:E541, A:V542, A:T543, A:R544, A:L545, A:Q546, A:S547, A:D548, A:L549, A:K550, A:D551, A:A552, A:E553, A:E554, A:N555, A:N556, A:V557, A:E558, A:D559, A:Y560, A:V561, A:K562, A:E563, A:G564, A:L565, A:P587, A:K588, A:A589, A:L590, A:D591, A:T592, A:A593, A:L594, A:N595, A:E596, A:L597, A:G598, A:P599, A:D600, A:G601, A:D602, A:E603, A:E604, A:E605, A:T606, A:L607 | 91 | 0.738 |
4 | A:Y183, A:E186, A:G187, A:E189, A:K190, A:T191, A:I192, A:A193, A:A194, A:K195, A:K196, A:A197, A:E198, A:L199, A:E200, A:K201, A:T202, A:E203, A:A204, A:D205, A:L206, A:K207, A:K208, A:A209, A:V210, A:N211, A:E212, A:Q254, A:P255, A:A256, A:P257, A:A258, A:P259, A:E260, A:K261, A:P262, A:A263, A:E264, A:K265, A:P266, A:A267, A:P268, A:A269, A:V270, A:D271, A:A273 | 46 | 0.709 |
5 | A:L331, A:G332, A:G333, A:D373, A:E374, A:E376, A:T377, A:E378, A:A379, A:A380, A:A381, A:E432, A:E433, A:S435, A:K436, A:L437, A:E438, A:D439, A:N440, A:L441, A:K442, A:D443, A:A444, A:E445, A:T446, A:N447, A:N448, A:V449, A:E450, A:D451 | 30 | 0.647 |
6 | A:N179, A:D182, A:K185 | 3 | 0.548 |
7 | A:A173, A:A174, A:E175, A:E176 | 4 | 0.514 |