TY - JOUR AU - Smolen, J. S. AU - Aletaha, D. AU - McInnes, I. B. PY - 2016 DA - 2016// TI - Rheumatoid arthritis JO - Lancet VL - 388 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(16)30173-8 DO - 10.1016/S0140-6736(16)30173-8 ID - Smolen2016 ER - TY - JOUR AU - Aletaha, D. AU - Smolen, J. S. PY - 2018 DA - 2018// TI - Diagnosis and management of rheumatoid arthritis: a review JO - JAMA VL - 320 UR - https://doi.org/10.1001/jama.2018.13103 DO - 10.1001/jama.2018.13103 ID - Aletaha2018 ER - TY - JOUR AU - Aletaha, D. AU - Neogi, T. AU - Silman, A. J. AU - Funovits, J. AU - Felson, D. T. AU - Bingham, C. O. AU - Birnbaum, N. S. AU - Burmester, G. R. AU - Bykerk, V. P. AU - Cohen, M. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - 2010 Rheumatoid arthritis classification criteria: an American College of Rheumatology/European League Against Rheumatism collaborative initiative JO - Arthritis Rheum VL - 62 UR - https://doi.org/10.1002/art.27584 DO - 10.1002/art.27584 ID - Aletaha2010 ER - TY - JOUR AU - Maksymowych, W. P. AU - Boire, G. AU - Schaardenburg, D. AU - Wichuk, S. AU - Turk, S. AU - Boers, M. AU - Siminovitch, K. A. AU - Bykerk, V. AU - Keystone, E. AU - Tak, P. P. PY - 2015 DA - 2015// TI - 14-3-3η Autoantibodies: Diagnostic Use in Early Rheumatoid Arthritis JO - J Rheumatol VL - 42 UR - https://doi.org/10.3899/jrheum.141385 DO - 10.3899/jrheum.141385 ID - Maksymowych2015 ER - TY - JOUR AU - Jonsson, M. K. AU - Sundlisæter, N. P. AU - Nordal, H. H. AU - Hammer, H. B. AU - Aga, A. B. AU - Olsen, I. C. AU - Brokstad, K. A. AU - Heijde, D. AU - Kvien, T. K. AU - Fevang, B. S. PY - 2017 DA - 2017// TI - Calprotectin as a marker of inflammation in patients with early rheumatoid arthritis JO - Ann Rheum Dis VL - 76 UR - https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2017-211695 DO - 10.1136/annrheumdis-2017-211695 ID - Jonsson2017 ER - TY - JOUR AU - Winter, L. M. AU - Hansen, W. L. AU - Steenbergen, H. W. AU - Geusens, P. AU - Lenaerts, J. AU - Somers, K. AU - Stinissen, P. AU - Helm-van Mil, A. H. AU - Somers, V. PY - 2016 DA - 2016// TI - Autoantibodies to two novel peptides in seronegative and early rheumatoid arthritis JO - Rheumatology (Oxford) VL - 55 UR - https://doi.org/10.1093/rheumatology/kew198 DO - 10.1093/rheumatology/kew198 ID - Winter2016 ER - TY - JOUR AU - Dunaeva, M. AU - Blom, J. AU - Thurlings, R. AU - Pruijn, G. J. M. PY - 2018 DA - 2018// TI - Circulating serum miR-223-3p and miR-16-5p as possible biomarkers of early rheumatoid arthritis JO - Clin Exp Immunol VL - 193 UR - https://doi.org/10.1111/cei.13156 DO - 10.1111/cei.13156 ID - Dunaeva2018 ER - TY - JOUR AU - Carr, H. L. AU - Turner, J. D. AU - Major, T. AU - Scheel-Toellner, D. AU - Filer, A. PY - 2020 DA - 2020// TI - New developments in transcriptomic analysis of synovial tissue JO - Front Med (Lausanne) VL - 7 UR - https://doi.org/10.3389/fmed.2020.00021 DO - 10.3389/fmed.2020.00021 ID - Carr2020 ER - TY - JOUR AU - Li, W. C. AU - Bai, L. AU - Xu, Y. AU - Chen, H. AU - Ma, R. AU - Hou, W. B. AU - Xu, R. J. PY - 2019 DA - 2019// TI - Identification of differentially expressed genes in synovial tissue of rheumatoid arthritis and osteoarthritis in patients JO - J Cell Biochem VL - 120 UR - https://doi.org/10.1002/jcb.27741 DO - 10.1002/jcb.27741 ID - Li2019 ER - TY - JOUR AU - Macías-Segura, N. AU - Castañeda-Delgado, J. E. AU - Bastian, Y. AU - Santiago-Algarra, D. AU - Castillo-Ortiz, J. D. AU - Alemán-Navarro, A. L. AU - Jaime-Sánchez, E. AU - Gomez-Moreno, M. AU - Saucedo-Toral, C. A. AU - Lara-Ramírez, E. E. PY - 2018 DA - 2018// TI - Transcriptional signature associated with early rheumatoid arthritis and healthy individuals at high risk to develop the disease JO - PLoS ONE VL - 13 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0194205 DO - 10.1371/journal.pone.0194205 ID - Macías-Segura2018 ER - TY - JOUR AU - Demircioğlu, D. AU - Cukuroglu, E. AU - Kindermans, M. AU - Nandi, T. AU - Calabrese, C. AU - Fonseca, N. A. AU - Kahles, A. AU - Lehmann, K. V. AU - Stegle, O. AU - Brazma, A. PY - 2019 DA - 2019// TI - A Pan-cancer transcriptome analysis reveals pervasive regulation through alternative promoters JO - Cell VL - 178 ID - Demircioğlu2019 ER - TY - JOUR AU - Kaczkowski, B. AU - Tanaka, Y. AU - Kawaji, H. AU - Sandelin, A. AU - Andersson, R. AU - Itoh, M. AU - Lassmann, T. AU - Hayashizaki, Y. AU - Carninci, P. AU - Forrest, A. R. PY - 2016 DA - 2016// TI - Transcriptome analysis of recurrently deregulated genes across multiple cancers identifies new pan-cancer biomarkers JO - Cancer Res VL - 76 UR - https://doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-15-0484 DO - 10.1158/0008-5472.CAN-15-0484 ID - Kaczkowski2016 ER - TY - JOUR AU - Salmena, L. AU - Poliseno, L. AU - Tay, Y. AU - Kats, L. AU - Pandolfi, P. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - A ceRNA hypothesis: the Rosetta Stone of a hidden RNA language? JO - Cell VL - 146 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2011.07.014 DO - 10.1016/j.cell.2011.07.014 ID - Salmena2011 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Hochberg, Y. PY - 1995 DA - 1995// TI - Controlling the false discovery rate - a practical and powerful approach to multiple testing JO - J R Stat Soc B VL - 57 ID - Benjamini1995 ER - TY - JOUR AU - Benjamini, Y. AU - Yekutieli, D. PY - 2001 DA - 2001// TI - The control of the false discovery rate in multiple testing under dependency JO - Ann Stat VL - 29 UR - https://doi.org/10.1214/aos/1013699998 DO - 10.1214/aos/1013699998 ID - Benjamini2001 ER - TY - JOUR AU - Wu, C. AU - Orozco, C. AU - Boyer, J. AU - Leglise, M. AU - Goodale, J. AU - Batalov, S. AU - Hodge, C. L. AU - Haase, J. AU - Janes, J. AU - Huss, J. W. AU - Su, A. I. PY - 2009 DA - 2009// TI - BioGPS: an extensible and customizable portal for querying and organizing gene annotation resources JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-11-r130 DO - 10.1186/gb-2009-10-11-r130 ID - Wu2009 ER - TY - JOUR AU - Wang, H. AU - Zhu, H. AU - Zhu, W. AU - Xu, Y. AU - Wang, N. AU - Han, B. AU - Song, H. AU - Qiao, J. PY - 2020 DA - 2020// TI - Bioinformatic analysis identifies potential key genes in the pathogenesis of turner syndrome JO - Front Endocrinol (Lausanne) VL - 11 UR - https://doi.org/10.3389/fendo.2020.00104 DO - 10.3389/fendo.2020.00104 ID - Wang2020 ER - TY - JOUR AU - Subramanian, A. AU - Tamayo, P. AU - Mootha, V. K. AU - Mukherjee, S. AU - Ebert, B. L. AU - Gillette, M. A. AU - Paulovich, A. AU - Pomeroy, S. L. AU - Golub, T. R. AU - Lander, E. S. AU - Mesirov, J. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Gene set enrichment analysis: a knowledge-based approach for interpreting genome-wide expression profiles JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 102 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0506580102 DO - 10.1073/pnas.0506580102 ID - Subramanian2005 ER - TY - JOUR AU - Xie, C. AU - Mao, X. AU - Huang, J. AU - Ding, Y. AU - Wu, J. AU - Dong, S. AU - Kong, L. AU - Gao, G. AU - Li, C. Y. AU - Wei, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - KOBAS 2.0: a web server for annotation and identification of enriched pathways and diseases JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr483 DO - 10.1093/nar/gkr483 ID - Xie2011 ER - TY - JOUR AU - Chin, C. H. AU - Chen, S. H. AU - Wu, H. H. AU - Ho, C. W. AU - Ko, M. T. AU - Lin, C. Y. PY - 2014 DA - 2014// TI - cytoHubba: identifying hub objects and sub-networks from complex interactome JO - BMC Syst Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1752-0509-8-S4-S11 DO - 10.1186/1752-0509-8-S4-S11 ID - Chin2014 ER - TY - JOUR AU - Luan, H. AU - Zhang, C. AU - Zhang, T. AU - He, Y. AU - Su, Y. AU - Zhou, L. PY - 2020 DA - 2020// TI - Identification of key prognostic biomarker and its correlation with immune infiltrates in pancreatic ductal adenocarcinoma JO - Dis Markers VL - 2020 UR - https://doi.org/10.1155/2020/8825997 DO - 10.1155/2020/8825997 ID - Luan2020 ER - TY - JOUR AU - Yang, X. AU - Li, Y. AU - Lv, R. AU - Qian, H. AU - Chen, X. AU - Yang, C. F. PY - 2019 DA - 2019// TI - Study on the multitarget mechanism and key active ingredients of herba siegesbeckiae and volatile oil against rheumatoid arthritis based on network pharmacology JO - Evid Based Complement Alternat Med VL - 2019 ID - Yang2019 ER - TY - JOUR AU - Li, J. H. AU - Liu, S. AU - Zhou, H. AU - Qu, L. H. AU - Yang, J. H. PY - 2014 DA - 2014// TI - starBase v2.0: decoding miRNA-ceRNA, miRNA-ncRNA and protein-RNA interaction networks from large-scale CLIP-Seq data JO - Nucleic Acids Res VL - 42 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt1248 DO - 10.1093/nar/gkt1248 ID - Li2014 ER - TY - JOUR AU - Croft, D. AU - O'Kelly, G. AU - Wu, G. AU - Haw, R. AU - Gillespie, M. AU - Matthews, L. AU - Caudy, M. AU - Garapati, P. AU - Gopinath, G. AU - Jassal, B. PY - 2011 DA - 2011// TI - Reactome: a database of reactions, pathways and biological processes JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkq1018 DO - 10.1093/nar/gkq1018 ID - Croft2011 ER - TY - JOUR AU - Kumar, R. AU - Indrayan, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Receiver operating characteristic (ROC) curve for medical researchers JO - Indian Pediatr VL - 48 UR - https://doi.org/10.1007/s13312-011-0055-4 DO - 10.1007/s13312-011-0055-4 ID - Kumar2011 ER - TY - JOUR AU - Anthony, D. A. AU - Andrews, D. M. AU - Watt, S. V. AU - Trapani, J. A. AU - Smyth, M. J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Functional dissection of the granzyme family: cell death and inflammation JO - Immunol Rev VL - 235 UR - https://doi.org/10.1111/j.0105-2896.2010.00907.x DO - 10.1111/j.0105-2896.2010.00907.x ID - Anthony2010 ER - TY - JOUR AU - Daalen, K. R. AU - Reijneveld, J. F. AU - Bovenschen, N. PY - 2020 DA - 2020// TI - Modulation of inflammation by extracellular granzyme A JO - Front Immunol VL - 11 UR - https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.00931 DO - 10.3389/fimmu.2020.00931 ID - Daalen2020 ER - TY - JOUR AU - Tak, P. P. AU - Spaeny-Dekking, L. AU - Kraan, M. C. AU - Breedveld, F. C. AU - Froelich, C. J. AU - Hack, C. E. PY - 1999 DA - 1999// TI - The levels of soluble granzyme A and B are elevated in plasma and synovial fluid of patients with rheumatoid arthritis (RA) JO - Clin Exp Immunol VL - 116 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2249.1999.00881.x DO - 10.1046/j.1365-2249.1999.00881.x ID - Tak1999 ER - TY - JOUR AU - Kummer, J. A. AU - Tak, P. P. AU - Brinkman, B. M. AU - Tilborg, A. A. AU - Kamp, A. M. AU - Verweij, C. L. AU - Daha, M. R. AU - Meinders, A. E. AU - Hack, C. E. AU - Breedveld, F. C. PY - 1994 DA - 1994// TI - Expression of granzymes A and B in synovial tissue from patients with rheumatoid arthritis and osteoarthritis JO - Clin Immunol Immunopathol VL - 73 UR - https://doi.org/10.1006/clin.1994.1173 DO - 10.1006/clin.1994.1173 ID - Kummer1994 ER - TY - JOUR AU - Jiang, W. AU - Jimenez, G. AU - Wells, N. J. AU - Hope, T. J. AU - Wahl, G. M. AU - Hunter, T. AU - Fukunaga, R. PY - 1998 DA - 1998// TI - PRC1: a human mitotic spindle-associated CDK substrate protein required for cytokinesis JO - Mol Cell VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/S1097-2765(00)80302-0 DO - 10.1016/S1097-2765(00)80302-0 ID - Jiang1998 ER - TY - JOUR AU - Falconer, J. AU - Murphy, A. N. AU - Young, S. P. AU - Clark, A. R. AU - Tiziani, S. AU - Guma, M. AU - Buckley, C. D. PY - 2018 DA - 2018// TI - Review: synovial cell metabolism and chronic inflammation in rheumatoid arthritis JO - Arthritis Rheumatol VL - 70 UR - https://doi.org/10.1002/art.40504 DO - 10.1002/art.40504 ID - Falconer2018 ER - TY - JOUR AU - Veale, D. J. AU - Orr, C. AU - Fearon, U. PY - 2017 DA - 2017// TI - Cellular and molecular perspectives in rheumatoid arthritis JO - Semin Immunopathol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1007/s00281-017-0633-1 DO - 10.1007/s00281-017-0633-1 ID - Veale2017 ER - TY - JOUR AU - Nygaard, G. AU - Firestein, G. S. PY - 2020 DA - 2020// TI - Restoring synovial homeostasis in rheumatoid arthritis by targeting fibroblast-like synoviocytes JO - Nat Rev Rheumatol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1038/s41584-020-0413-5 DO - 10.1038/s41584-020-0413-5 ID - Nygaard2020 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Winey, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - The MPS1 family of protein kinases JO - Annu Rev Biochem VL - 81 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-biochem-061611-090435 DO - 10.1146/annurev-biochem-061611-090435 ID - Liu2012 ER - TY - JOUR AU - Ah-Kim, H. AU - Zhang, X. AU - Islam, S. AU - Sofi, J. I. AU - Glickberg, Y. AU - Malemud, C. J. AU - Moskowitz, R. W. AU - Haqqi, T. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Tumour necrosis factor alpha enhances the expression of hydroxyl lyase, cytoplasmic antiproteinase-2 and a dual specificity kinase TTK in human chondrocyte-like cells JO - Cytokine VL - 12 UR - https://doi.org/10.1006/cyto.1999.0539 DO - 10.1006/cyto.1999.0539 ID - Ah-Kim2000 ER - TY - JOUR AU - Brennan, F. M. AU - Maini, R. N. AU - Feldmann, M. PY - 1992 DA - 1992// TI - TNF alpha–a pivotal role in rheumatoid arthritis? JO - Br J Rheumatol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1093/rheumatology/31.5.293 DO - 10.1093/rheumatology/31.5.293 ID - Brennan1992 ER - TY - JOUR AU - Zhang, Y. AU - Yan, N. AU - Wang, X. AU - Chang, Y. AU - Wang, Y. PY - 2019 DA - 2019// TI - MiR-129–5p regulates cell proliferation and apoptosis via IGF-1R/Src/ERK/Egr-1 pathway in RA-fibroblast-like synoviocytes JO - Biosci Rep VL - 39 ID - Zhang2019 ER - TY - JOUR AU - Tseng, C. C. AU - Wu, L. Y. AU - Tsai, W. C. AU - Ou, T. T. AU - Wu, C. C. AU - Sung, W. Y. AU - Kuo, P. L. AU - Yen, J. H. PY - 2019 DA - 2019// TI - Differential expression profiles of the transcriptome and miRNA interactome in synovial fibroblasts of rheumatoid arthritis revealed by next generation sequencing JO - Diagnostics (Basel) VL - 9 ID - Tseng2019 ER - TY - JOUR AU - Kurowska, W. AU - Kuca-Warnawin, E. AU - Radzikowska, A. AU - Jakubaszek, M. AU - Maślińska, M. AU - Kwiatkowska, B. AU - Maśliński, W. PY - 2018 DA - 2018// TI - Monocyte-related biomarkers of rheumatoid arthritis development in undifferentiated arthritis patients - a pilot study JO - Reumatologia VL - 56 UR - https://doi.org/10.5114/reum.2018.74742 DO - 10.5114/reum.2018.74742 ID - Kurowska2018 ER - TY - JOUR AU - Liu, Y. AU - Zhang, X. L. AU - Li, X. F. AU - Tang, Y. C. AU - Zhao, X. PY - 2018 DA - 2018// TI - miR-212-3p reduced proliferation, and promoted apoptosis of fibroblast-like synoviocytes via down-regulating SOX5 in rheumatoid arthritis JO - Eur Rev Med Pharmacol Sci VL - 22 ID - Liu2018 ER - TY - JOUR AU - Shui, X. AU - Chen, S. AU - Lin, J. AU - Kong, J. AU - Zhou, C. AU - Wu, J. PY - 2019 DA - 2019// TI - Knockdown of lncRNA NEAT1 inhibits Th17/CD4(+) T cell differentiation through reducing the STAT3 protein level JO - J Cell Physiol VL - 234 UR - https://doi.org/10.1002/jcp.28811 DO - 10.1002/jcp.28811 ID - Shui2019 ER - TY - JOUR AU - Mougeot, J. L. AU - Noll, B. D. AU - Bahrani Mougeot, F. K. PY - 2019 DA - 2019// TI - Sjögren's syndrome X-chromosome dose effect: an epigenetic perspective JO - Oral Dis VL - 25 UR - https://doi.org/10.1111/odi.12825 DO - 10.1111/odi.12825 ID - Mougeot2019 ER -