Skip to main content

Table 4 MHC class-II allele binding epitopes predicted using Propred with their antigenicity scores

From: Epitope‐based peptide vaccine design and target site depiction against Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus: an immune-informatics study

Sr#

Peptides

MHC class-II alleles

Vaxijen score

1

YCILEPRSG

DRB5_0105, DRB5_0101, DRB1_1328, DRB1_1327, DRB1_1323, DRB1_1307, DRB1_1305, DRB1_1302, DRB1_1301, DRB1_1128, DRB1_1120, DRB1_1114, DRB1_1101, DRB1_0802, DRB1_0101

1.5044

2

LYFMHVGYY

DRB1_0301, DRB1_0802, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321

1.4863

3

MRLASIAFN

DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308

DRB1_0311, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328

1.4844

4

FGITQTAQG

DRB1_1321, DRB1_1307, DRB1_1305, DRB1_1128

DRB1_1101, DRB1_0801, DRB1_0426, DRB1_0421

DRB1_0401

1.3764

5

VRIGAAANS

DRB1_1328, DRB1_1327, DRB1_1322, DRB1_1301

DRB1_1121, DRB1_1107, DRB1_1102, DRB1_0426

DRB1_0402, DRB1_0401, DRB1_0311, DRB1_0308

DRB1_0307, DRB1_0306, DRB1_0301

1.1906

6

VYKLQPLTF

DRB5_0101, DRB5_0105, DRB1_1327, DRB1_1328

DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1305, DRB1_1311

1.1127