From: Associations of clock genes polymorphisms with soft tissue sarcoma susceptibility and prognosis
Gene | SNP ID | Genotype | Ctrls | Cases | P-val. | Chr | Region | Residue | Ref in cancer |
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CLOCK | rs1801260 | TT | 323 | 92 | 0.21 | 4 | 3′-UTR |  | |
 |  | TC | 228 | 62 |  |  |  |  |  |
 |  | CC | 56 | 8 |  |  |  |  |  |
 | rs3736544 | GG | 241 | 60 | 0.72 | 4 | Exon | Asn>Asn |  |
 |  | GA | 269 | 78 |  |  |  |  |  |
 |  | AA | 95 | 24 |  |  |  |  |  |
 | rs3749474 | CC | 259 | 62 | 0.45 | 4 | 3′-UTR |  | |
 |  | CT | 266 | 80 |  |  |  |  |  |
 |  | TT | 83 | 20 |  |  |  |  |  |
 | rs34897046 | GG | 566 | 149 | 0.60 | 4 | Exon | Ser>Cys |  |
 |  | GC | 40 | 13 |  |  |  |  |  |
 |  | CC | 1 | 0 |  |  |  |  |  |
NPAS2 | rs895520 | GG | 211 | 49 | 0.20 | 2 | Intron | Â | |
 |  | GA | 294 | 76 |  |  |  |  |  |
 |  | AA | 103 | 37 |  |  |  |  |  |
 | rs2305160 | GG | 283 | 75 | 1.00 | 2 | Exon | Thr>Ala | [10, 14, 15, 21, 23, 26, 27, 34,35,36,37,38,39,40,41,42,43,44,45] |
 |  | GA | 264 | 71 |  |  |  |  |  |
 |  | AA | 59 | 16 |  |  |  |  |  |
PER1 | rs3027178 | TT | 281 | 84 | 0.29 | 17 | Exon | Thr>Thr | |
 |  | TG | 253 | 64 |  |  |  |  |  |
 |  | GG | 76 | 14 |  |  |  |  |  |
PER2 | rs934945 | CC | 386 | 118 | 0.07 | 2 | Exon | Gly>Glu | |
 |  | CT | 206 | 42 |  |  |  |  |  |
 |  | TT | 17 | 2 |  |  |  |  |  |
 | rs7602358 | TT | 358 | 87 | 0.49 | 2 | Intron |  | |
 |  | TG | 213 | 64 |  |  |  |  |  |
 |  | GG | 38 | 11 |  |  |  |  |  |
RORA | rs339972 | TT | 312 | 97 | 0.15 | 15 | Intron | Â | |
 |  | TC | 233 | 53 |  |  |  |  |  |
 |  | CC | 62 | 12 |  |  |  |  |  |
 | rs10519097 | CC | 422 | 110 | 0.67 | 15 | Intron |  | |
 |  | CT | 173 | 50 |  |  |  |  |  |
 |  | TT | 14 | 2 |  |  |  |  |  |
TIMELESS | rs774027 | AA | 157 | 44 | 0.63 | 12 | Exon | Ile > Val | |
 |  | AT | 301 | 74 |  |  |  |  |  |
 |  | TT | 148 | 44 |  |  |  |  |  |
 | rs3809125 | CC | 250 | 70 | 0.87 | 12 | Upstream |  |  |
 |  | CT | 280 | 71 |  |  |  |  |  |
 |  | TT | 74 | 20 |  |  |  |  |  |
 | rs7302060 | TT | 181 | 55 | 0.53 | 12 | Intron |  | |
 |  | TC | 304 | 74 |  |  |  |  |  |
 |  | CC | 121 | 33 |  |  |  |  |  |