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Table 4 T cell epitopes against MHC class II alleles through propred

From: Peptide vaccine against chikungunya virus: immuno-informatics combined with molecular docking approach

Serial no

Peptide

MHC class II alleles

Score

1

FKRSSKYDL

DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105

1.054

2

LLANTTFPC

DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323

1.0945 

3

LKIQVSLQI

DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506

0.9054

4

FVRTSAPCTI

DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0421, DRB1_0426,

1.0082

5

VGFTDSRKI

DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105

1.0491

6

VRYKCNCGG

DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817,

2.2127 

7

WVMHKKEVV

DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502

1.0706

8

LVVAVAALILIVVLCVSFSR

DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105

0.909