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Table 4 T cell epitopes against MHC class II alleles through propred

From: Peptide vaccine against chikungunya virus: immuno-informatics combined with molecular docking approach

Serial no Peptide MHC class II alleles Score
1 FKRSSKYDL DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_0105 1.054
2 LLANTTFPC DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1322, DRB1_1323 1.0945 
3 LKIQVSLQI DRB1_0101, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_1506 0.9054
4 FVRTSAPCTI DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0421, DRB1_0426, 1.0082
5 VGFTDSRKI DRB1_0402, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_0105 1.0491
6 VRYKCNCGG DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, 2.2127 
7 WVMHKKEVV DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0813, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1502 1.0706
8 LVVAVAALILIVVLCVSFSR DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_1102, DRB1_1107, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_0105 0.909