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Table 2 Somatic mutations detected by the cancer hotspot panel v2 in CRC

From: Clinical significance of frequent somatic mutations detected by high-throughput targeted sequencing in archived colorectal cancer samples

Gene

Mutations detected

TP53

p.Ala69Val, p.Pro72Ala, p.Pro72Ser, p.Thr81Ile, p.Pro82Leu, p.Ala84Val, p.Pro87Leu, p.Trp91Ter, p.Ser94Ter, p.Ser95Phe, p.Ser96Phe, p.Pro98Leu, p.Ser99Phe, p.Gln100Ter, p.Arg110Leu, p.Leu130Ile, p.Lys132Arg, p.Cys135Ter, p.Leu137Gln, p.Pro151Thr, p.Pro152Leu, p.Gly154Asp, p.Gly154Ser, p.Arg156His, p.Val157Ile, p.Val157Phe, p.Ala161Thr, p.Tyr163Cys, p.Gln165Ter, p.Ser166Leu, p.His168Pro, p.His168Tyr, p.Glu171Lys, p.Val172Ile, p.Val173Ala, p.Val173Met, p.Arg175His, p.Arg175Leu, p.Pro177Ser, p.His179Arg, p.His179Tyr, p.Cys182Tyr, p.Ser183Leu, p.Gly187Ser, p.Pro190 fs, p.Arg196Ter, p.Gly199Glu, p.Arg202Cys, p.Arg209 fs, p.Thr211Ile, p.Arg213Ter, p.Ser215Asn, p.Val216Met, p.Tyr220Asn, p.Tyr220Cys, p.Glu221Gly, p.Gly226Ser, p.Cys229Tyr, p.Tyr234Cys, p.Cys238Tyr, p.Ser240Arg, p.Ser240Asn, p.Gly244Asp, p.Gly245Ser, p.Met246Val, p.Arg248Gln, p.Arg248Trp, p.Arg249Ser, p.Thr253Ile, p.Glu258Gln, p.Gly266Arg, p.Gly266Glu, p.Arg267Gln, p.Ser269Asn, p.Glu271Lys, p.Val272Met, p.Arg273Cys, p.Arg273His, p.Cys275Phe, p.Cys277Phe, p.Gly279Glu, p.Arg280Lys, p.Asp281Asn, p.Arg282Trp, p.Glu285Lys, p.Glu287Lys, p.Arg290His, p.Pro300Leu, p.Pro300Ser, p.Gly302Glu, p.Arg306Ter, p.Glu336Lys, c.559 + 3G > C, c.560-1G > C, c.376-1G > A

APC

p.Asn869Thr, p.Arg876Ter, p.Arg1114Ter, p.Glu1286Ter, p.Ala1296 fs, p.Ala1299Val, p.Ile1307Lys, p.Ile1307 fs, p.Glu1309Ter, p.Glu1309 fs, p.Ala1351Thr, p.Ser1356Ter, p.Ser1360Tyr, p.Gln1367Ter, p.Glu1374Ter, p.Gln1378Ter, p.Glu1379Ter, p.Pro1439Leu, p.Arg1450Ter, p.Glu1461Lys, p.Ser1465 fs, p.Leu1488 fs, p.Leu1488Ter, p.His1490Leu, p.His1490 fs, p.Ser1495 fs, p.Ser1501 fs, p.Thr1556 fs, p.Glu1576Lys, p.Glu1577Ter

KRAS

p.Ala11Val, p.Gly12Val, p.Gly12Ser, p.Gly12Asp, p.Gly13Asp, p.Val14Ile, p.Gln22Lys, p.Gln61His, p.Ala146Thr

PIK3CA

p.Arg88Gln, p.Arg108His, p.Leu339Ile, p.Asn345Lys, p.Asp350Gly, p.Cys420Arg, p.Pro539His, p.Glu542Lys, p.Glu545Asp, p.Glu545Gly, p.Glu545Lys, p.Gln546His, p.Arg1023Ter, p.Thr1025Ala, p.Asn1044Ser, p.His1047Arg, p.His1048Arg, p.Ala1066Thr, p.Ter1069 fs

PTEN

p.Lys6Glu, p.Glu7Ter, p.Asp24Asn, p.Gln110Ter, p.Asp115Asn, p.Cys124Tyr, p.Ala126Val, p.Arg130Gln, p.Gly165Glu, p.Ser170Asn, p.Gln171Ter, p.Arg173Cys, p.Pro246Leu, p.Val255Ile, p.Glu256Lys, p.Pro339Ser

SMAD4

p.Arg100Met, p.Arg135Ter, p.Gln245Ter, p.Gln248Ter, p.Thr259Ile, p.Glu330Lys, p.Ser343Ter, p.Gly352Arg, p.Arg361His, p.Arg361His, p.Arg361His, p.Cys499Tyr, p.Arg531Gln

EGFR

p.Gly109Glu, p.Gly696Arg, p.Pro699Ser, p.Gly719Ser, p.Gly719Cys, p.Gly721Ser, p.Trp731Ter, p.Glu746Lys, p.Thr751Ile, p.Ala755Thr, p.Glu758Lys, p.Leu858Met, p.Gly863Asp, p.Ala864Val, p.Gly873Glu

FBXW7

p.Arg465Cys, p.Arg465His, p.Met467Ile, p.Arg479Gln, p.Arg479Pro, p.Arg479Ter

BRAF

p.Gly469Val, p.Gly469Ala, p.Val600Glu, p.Lys601Glu

RB1

p.Ile680Thr, p.Leu683Phe

RET

p.Cys618Tyr, p.Asp627Gly, p.Glu884Val, p.Glu901Lys, p.Leu923Phe

ATM

p.Val410Ala, p.Phe858Leu, p.Thr1735 fs, p.Leu2866Val

NOTCH1

p.Arg1598His, p.His1601Leu, p.Pro2438Ser, p.Gln2440Ter

STK11

p.Glu165Lys, p.Gly171Ser, p.Gly279Arg, p.Phe354Leu

KIT

p.Pro37Ser, p.Arg49His, p.Asp52Asn, p.Asp572Asn

KDR

p.Lys270Asn, p.Gly1145Glu, p.Pro1354Ser

CDH1

pThr342Ile, p.Thr399Ile

PTPN11

p.Glu69Lys, p.Thr73Ile, p.Glu76Lys

ERBB2

p.Met774Ile, p.Val851Met, p.Thr862Ala, p.His878Tyr

SMO

p.Val404Met, p.Leu412Phe, p.Pro634Leu

CTNNB1

p.Met12Ile, p.Pro16Ser, p.Val22Ile, p.Ser37Phe

VHL

p.Gln132Ter, p.Arg161Gln, p.Arg167Gln, c.341-1G > A

CDKN2A

p.Glu88Lys, p.Arg99Trp, p.Asp125Asn, p.Arg128Gln

FLT3

p.Ser446Leu, p.Lys602Arg, p.Trp603Ter

IDH2

p.Arg140Gln, p.Arg140Trp

FGFR3

p.Asp643Asn, p.Ala719Thr

MPL

p.Ala506Thr, p.Ala519Val, p.Ala519Thr

PDGFRA

p.Pro553Leu, p.Glu563Lys

NRAS

p.Gln61Arg

MET

c.2942-20_2943del22, p.Asn375Ser

MLH1

p.His381Arg

HRAS

p.Glu63Lys

JAK3

p.Ala573Val

AKT1

p.Glu49Lys

ERBB4

p.Pro616Ser

JAK3

p.Ala572Thr

SMARCB1

p.Arg190Gln

ABL1

p.Thr334Ile